游戏初始阶段的关键在于合理选择初始宝可梦并快速掌握基础操作。从真新镇出发后，玩家需要前往大木研究所选择初始宝可梦，建议优先考虑属性优势明显的小火龙，其后期进化形态喷火龙在对抗岩石系和水系道馆时具有显著优势。拿到宝可梦图鉴后，应立即前往常磐市商店获取快递包裹并交还给大木博士，这是开启主线剧情的必要步骤。在1号道路和常磐森林的探索过程中，建议捕捉皮卡丘和绿毛虫作为辅助战力，前者可学习闪光技能解决洞穴照明问题，后者进化后的巴大蝴掌握催眠粉和麻痹粉将成为捕捉神兽的重要工具。
道馆挑战是推进剧情的核心环节，需要根据各馆主属性制定针对性策略。尼比市的岩石系道馆建议使用水系或草系技能快速解决，而华蓝市的水系道馆则需依赖电系或草系攻击。特别值得注意的是枯叶市的电系道馆，其机关设计较为复杂，需要在垃圾桶区域连续触发两个隐藏开关才能挑战馆主。在此期间，玩家应充分利用月见山获得的化石复活宝可梦，以及正辉赠送的船票开启圣安奴号游轮事件，这些支线内容不仅能提供丰富经验值，还能获得关键道具如居合斩和闪光技能机。
火箭队相关剧情是串联主线的重要线索，需重点关注彩虹市游戏厅和紫苑镇宝可梦塔的隐藏事件。在彩虹市游戏厅击败特定火箭队成员后，调查海报可发现秘密基地入口，通过击败地下四层的守卫获取电梯钥匙，最终与坂木老大对决并获得观测镜。紫苑镇宝可梦塔的幽灵事件则需要先解决彩虹市剧情获取观测镜，才能看清阻挡道路的嘎啦嘎啦并将其击败。这些剧情节点不仅推动故事发展，还能解锁稀有宝可梦的捕捉机会，如希鲁佛公司大楼救出事件后获得的乘龙。
