击败肉山后，游戏正式进入困难模式，玩家需要优先解锁新矿物并强化装备。使用肉山掉落的神圣之锤敲碎腐化/猩红之地的恶魔祭坛，每次敲碎会刷新钴蓝/钯金、秘银/山铜、精金/钛金三种进阶矿石。建议优先制作钴蓝/钯金镐用于挖掘更高级矿物，随后逐步合成秘银砧和精金熔炉来打造全套防具与武器。此阶段需注意地下新增的强力怪物，建议在矿洞探索时携带生命探测药水与危险感药水。
完成基础装备升级后，应着手准备挑战机械三王——毁灭者、双子魔眼和机械骷髅王。机械BOSS的召唤物可通过击败特定怪物随机掉落，或在秘银砧用机械零件、光明/黑暗之魂合成。战斗前需搭建多层平台战场并配备心灯、篝火等增益设施，远程职业推荐使用代达罗斯风暴弓或玛瑙散弹枪，近战职业可选择冰雪镰刀或永夜之刃。击败机械BOSS可获得神圣锭，用于制作神圣套装与更高级工具。
当击败全部机械BOSS后，丛林将生成世纪之花花苞。建议使用乌龟套或叶绿套搭配吸血类武器如死神镰刀，在丛林环境建造环形轨道进行战斗。击败世纪之花会掉落神庙钥匙，进入神庙需注意解除压力板陷阱，最终挑战石巨人BOSS可获得日曜碑牌碎片。此阶段还需收集火星暴乱事件中的飞碟坐骑，为后续战斗提供机动性保障。
最终阶段需前往地牢入口击败拜月教信徒触发月球事件。四柱攻略顺序推荐为星尘柱、星璇柱、星云柱、日耀柱，其中日耀柱需特别注意地面作战避免触发飞天蜈蚣。击败全部天界柱后，月球领主将在60秒后降临。建议使用甲虫套或星旋套搭配 UFO 坐骑，在长达300格的铁轨平台上保持移动，专注攻击其手部与头部核心。击败月球领主后可通过远古操纵机制作天界符咒重复召唤，至此游戏主线流程基本完成。
后续可尝试专家模式或安装MOD扩展内容，也可继续完善建筑、完成全物品收集等挑战性内容。整个肉山后流程需注意神圣/腐化地蔓延问题，建议用向日葵或隔离带控制地形变化。各阶段装备选择应结合职业特性，及时补充弹药与药水储备，合理利用NPC出售的进阶道具如叶之翼等提升战斗效率。
